Впервые на Вологодчине показаны материалы монастырской археологии. В экспозиции представлено более 4 000 археологических предметов различных хронологических периодов: от мезолита (IXтыс. до н.э.) до позднего средневековья. Наиболее полно показан период средневековья, и это делает экспозицию одной из крупнейших на северо-западе России.
В обширных сводчатых палатах монастырской Поварни XVI века размещаются выставки посвященные народному прикладному искусству, ремеслам и промыслам Белозерья.
Музеефикация монашеской кельи XVII века и примыкающих к ней помещений дала возможность представить архитектурный облик и интерьер жилища рядового инока Кирилло-Белозерского монастыря
27.06.2011
25 июня в День города Кириллова на территории музея состоялся праздник «Город и его музей».
Для гостей и жителей города была проведена игровая программа, мастер классы, концерт ансамбля «Белое озеро» и открыты все выставки и экспозиции музея. В этот день на мероприятиях музея побывало 2539 человек.
