Впервые на Вологодчине показаны материалы монастырской археологии. В экспозиции представлено более 4 000 археологических предметов различных хронологических периодов: от мезолита (IXтыс. до н.э.) до позднего средневековья. Наиболее полно показан период средневековья, и это делает экспозицию одной из крупнейших на северо-западе России.
В обширных сводчатых палатах монастырской Поварни XVI века размещаются выставки посвященные народному прикладному искусству, ремеслам и промыслам Белозерья.
Музеефикация монашеской кельи XVII века и примыкающих к ней помещений дала возможность представить архитектурный облик и интерьер жилища рядового инока Кирилло-Белозерского монастыря
04.12.2008
На базе музея состоялся семинар воспитателей детских садов по теме "Формирование исторического сознания"
Воспитателям детских садов города были предложены лекции, тематическая экскурсия по экспозиции "История Кирилло-Белозерского монастыря". Также совместно с сотрудниками музея были подготовлены листы активности с заданиями для дошкольников.